方舟子今日发布微博称正式起诉崔永元侵害其名誉，索赔30万，要求其删除微博登报道歉。随后崔永元回应道：“我认为你胜诉的机率等于零，还是要鼓励你走正路不走邪路。”
1月13日，方舟子起诉崔永元侵害名誉权的民事起诉状中写道，2013年9月崔永元发微博信息：“#转基因食品，你吃吗#你可以选择吃，我可以选择不吃。你可以说你懂‘科学'，我有理由有权利质疑你懂的‘科学'到底科学不科学。你可以说我白痴，我也可以说你白吃”。之后，原告发微博：“你当然可以选择不吃，但是不要传谣阻碍中国农业技术发展。我科普的是各国际权威科学机构认可的科学，你根本不懂，有何资格质疑？”双方进行了争论，原告指出被告许多言论没有事实依据。再后，被告转各种各样的涉及原告的谣言，对原告进行人身攻击；被告还发表了数十条对原告的侮辱、诽谤微博。
而随即崔永元对方舟子的起诉进行了回应：“肘子诉状写完了，现在可以有时间整理一下自己造过多少谣、侮辱过多少人、犯过多少次法了。新春伊始，万象更新，你重新做人的机会到了。不得不表扬的是，你终于选择了一次正确地解决问题的方法，早知如此，何必当初。当然我认为你胜诉的机率等于零，还是要鼓励你走正路不走邪路。”